L’Indonésie combine un vaste marché intérieur et une demande croissante en protéines animales. L’élevage constitue ainsi un pilier des ambitions de sécurité alimentaire du pays ; en 2025, il représentait 16,35 % de la valeur ajoutée agricole nationale. Cependant, c’est un secteur à deux vitesses, avec une filière avicole fortement intégrée et industrialisée et, d'un autre côté, des productions bovines, laitières, caprines et ovines encore largement dominées par de petites exploitations familiales. La filière avicole est autosuffisante et produit plus de 3,9 milliards de volailles par an : 4,06 M T de viande de poulet, 6,31 M T d’œufs de poule et 290 000 T d’œufs de canard. À l’inverse, la production laitière (821 000 T) ne couvre que 21 % de la demande nationale. L’île de Java domine les filières avicole et laitière. L’Indonésie est également le 3e producteur mondial de produits de la mer avec 24,57 M T produites en 2024, dont 17,18 M T de l’aquaculture, destinés en grande partie à l’export. Le programme de repas nutritifs gratuits du Président de la République Prabowo Subianto soutient la demande en protéines animales et contribue à l’accélération des investissements dans la filière laitière et l’augmentation du cheptel. Les autorités poursuivent les objectifs d’autosuffisance alimentaire tout en répondant à plusieurs défis : usage excessif d’antibiotiques, faible traçabilité, limites de la chaîne du froid, modernisation des abattoirs et prévention des épizooties. Le plan national "One Health" 2025-2029 a pour objectif de renforcer la biosécurité, le contrôle sanitaire et l’encadrement de l’utilisation des antimicrobiens.